RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 EID2BQ96D98 161 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF12Q99081 682 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC17A6Q9P2U8 582 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM49D1C9J1S8 452 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A1P02730 911 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-ND3P03897 115 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRRQ15256 657 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17RCQ8NAC3 791 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB7BQ96AH8 199 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PBXIP1Q96AQ6 731 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC8Q9BY41 377 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH12Q9NPG4 1184 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD18Q9NS91 495 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PFDN6O15212 129 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ADH1BP00325 375 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R2AP63151 447 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC15Q0P6D6 951 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND6AQ8IWF6 608 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD6BQ8N6M0 293 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SMC6Q96SB8 1091 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBPLQ9UIM3 349 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SORCS3Q9UPU3 1222 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 H0Y858 1186 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 AHSGP02765 367 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 LHCGRP22888 699 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CD151P48509 253 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK3P51956 506 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PTSQ03393 145 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCQQ04759 706 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CTBP1Q13363 440 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf27AQ580R0 203 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL19Q6PCT2 694 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN33Q86UF1 283 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T3Q8NH03 318 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ACMSDQ8TDX5 336 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ARRDC3Q96B67 414 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH19Q9H159 772 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PKD2L2Q9NZM6 624 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RGSL1A5PLK6 1076 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ANTXRLA6NF34 631 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD11O00231 422 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL22O00626 93 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP1P13497 986 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MC4RP32245 332 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXN2P32314 431 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAM1P38567 509 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP12P39900 470 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 STC1P52823 247 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZP2Q05996 745 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CCINQ13939 588 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TYSND1Q2T9J0 566 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH9Q5TGP6 573 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM7AQ6ZMT4 941 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS39Q96JC1 886 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFA1Q9NP55 256 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HMX2A2RU54 273 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HPDP32754 393 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 WASP42768 502 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 XIAPP98170 497 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SATB1Q01826 763 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG1Q06432 222 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX6Q13608 980 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 DTX3LQ8TDB6 740 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ISL2Q96A47 359 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR22Q99680 433 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51F1A6NGY5 319 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA7A6NL88 538 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 C7P10643 843 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRB3P13945 408 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 BRAFP15056 766 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 C5AR1P21730 350 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC18A1P54219 525 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CST6Q15828 149 aa30.95■■■□□ 2.55
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