RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583301.5

NSRP1-210, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 3

Gene NSRP1, Length 684 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-210	ENST00000583301	CA4	P22748	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	TRIM23	P36406	574 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	GPR1	P46091	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	GNPDA1	P46926	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	GABRE	P78334	506 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RTP5	Q14D33	572 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	NAT6	Q93015	286 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62	3e-6	■■■□□ 18.1
NSRP1-210	ENST00000583301	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CLDN7	O95471	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SLC4A1	P02730	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CES1	P23141	567 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SLC1A1	P43005	524 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	POLD2	P49005	469 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ZNF75D	P51815	510 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CDK3	Q00526	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PTS	Q03393	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SPIDR	Q14159	915 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	GALNT3	Q14435	633 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PDK1	Q15118	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SPA17	Q15506	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PCSK7	Q16549	785 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	FATE1	Q969F0	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AGRP	O00253	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	TNFRSF10C	O14798	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	INPP4B	O15327	924 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	PRL	P01236	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CEACAM5	P06731	702 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	MMP2	P08253	660 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ZNF30	P17039	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	ITPKB	P27987	946 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	STC1	P52823	247 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SKOR1	P84550	965 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-210	ENST00000583301	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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