RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		E7ENQ6	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		H7C0C1	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QYV0	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DNM1L	O00429	736 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NEMP1	O14524	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF11	O14901	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD3	O43242	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MGRN1	O60291	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HUS1	O60921	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARIH2	O95376	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	F9	P00740	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PGK2	P07205	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCL8	P10145	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ALAD	P13716	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MTHFD2	P13995	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNE1	P15382	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TAC1	P20366	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCND1	P24385	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CD38	P28907	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHX2	P34913	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CHKA	P35790	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GJC1	P36383	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FDFT1	P37268	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP5O	P48047	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNAR2	P48551	515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HCAR3	P49019	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS41	P49754	854 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCN3	P51790	818 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CHN2	P52757	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NDST1	P52848	882 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BCAT1	P54687	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OSTN	P61366	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OGDH	Q02218	1023 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BNIP1	Q12981	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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