RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RFX4Q33E94 735 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CERS5Q8N5B7 392 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 FAR1Q8WVX9 515 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MRIQ9BWK5 157 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 AGRPO00253 132 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM32Q13049 653 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 MED22Q15528 200 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TCEA2Q15560 299 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 PAGE1O75459 146 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 TPSB2P20231 275 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM138Q9NPI0 162 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRM-211ENST00000580170 GPR152Q8TDT2 470 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRM-211ENST00000580170 CDH22Q9UJ99 828 aa21.33■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 MYL9P24844 172 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL24Q6TFL4 600 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D21Q8IYX1 336 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RBFAQ8N0V3 343 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 CSH2P0DML3 217 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 LIN52Q52LA3 116 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM74Q86UV6 250 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM73Q86UV7 250 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CORO1BQ9BR76 489 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CES1P23141 567 aa21.32■■□□□ 1
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