RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	ATL2	Q8NHH9	583 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC45	Q96CN5	670 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA13	Q96N96	652 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44	9e-7	■■■■□ 22.9
RBM23-231	ENST00000557549	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CDH19	Q9H159	772 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GBA3	Q9H227	469 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	USP29	Q9HBJ7	922 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KNTC1	P50748	2209 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KCNN4	O15554	427 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NDST3	O95803	873 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CSF2	P04141	144 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	MYF5	P13349	255 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TSHR	P16473	764 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NFKB1	P19838	968 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	LHCGR	P22888	699 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HTR1B	P28222	390 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM23	P36406	574 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ACADVL	P49748	655 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	THOP1	P52888	689 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GEM	P55040	296 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	DPT	Q07507	201 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ACOX1	Q15067	660 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	IRF4	Q15306	451 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	QPCT	Q16769	361 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PARG	Q86W56	976 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NUS1	Q96E22	293 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	DTD2	Q96FN9	168 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PBK	Q96KB5	322 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TBATA	Q96M53	351 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549		H3BM21	787 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KIF5C	O60282	957 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GCAT	O75600	419 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KRT37	O76014	449 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ALPI	P09923	528 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CKMT2	P17540	419 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CTPS1	P17812	591 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GM2A	P17900	193 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HLA-DPA1	P20036	260 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KEL	P23276	732 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	STC1	P52823	247 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	WNT3A	P56704	352 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PTS	Q03393	145 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PTPRR	Q15256	657 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CCNG2	Q16589	344 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CDKN3	Q16667	212 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	P3H1	Q32P28	736 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KDELC1	Q6UW63	502 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	MACC1	Q6ZN28	852 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	OR4C6	Q8NH72	309 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	APOO	Q9BUR5	198 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TRABD	Q9H4I3	376 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HACD3	Q9P035	362 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.31	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	MYLK	Q15746	1914 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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