RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 TMEM135Q86UB9 458 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 RTP4Q96DX8 246 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 TRIM15Q9C019 465 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 A0A087X1B8 175 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CLCN5P51795 746 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 NR1H2P55055 460 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 GPSM1Q86YR5 675 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PARP8Q8N3A8 854 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 TTC3P53804 2025 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 A0A0U1RQF3 1178 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 A8MT66 165 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 E7ENX8 843 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PPP6CO00743 305 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 NRP2O60462 931 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 NEDD8Q15843 81 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 TRIB2Q92519 343 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SORT1Q99523 831 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SEPT3Q9UH03 358 aa14.85□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PIP5K1BO14986 540 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 MC4RP32245 332 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PTPRRQ15256 657 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ADRM1Q16186 407 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FBXO30Q8TB52 745 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 LINGO1Q96FE5 620 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FCRL5Q96RD9 977 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 GPR22Q99680 433 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PDLIM1O00151 329 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 AZIN1O14977 448 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 NIPSNAP2O75323 286 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 EPGNQ6UW88 154 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 IGSF8Q969P0 613 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 BTBD9Q96Q07 612 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 KLQ9UEF7 1012 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CEP290O15078 2479 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 I6L893 689 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 KPNA6O60684 536 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 UGT1A6P19224 532 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CYP2C18P33260 490 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PLCL1Q15111 1095 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 IL23RQ5VWK5 629 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 C19orf60Q96EN9 201 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 OLFM1Q99784 485 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 MATN2O00339 956 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 GPR39O43194 453 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 SNAP91O60641 907 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 C1RP00736 705 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 KCNA5P22460 613 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 LPIN1Q14693 890 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ZIC5Q96T25 663 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 C1orf21Q9H246 121 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 ASB8Q9H765 288 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 HPS4Q9NQG7 708 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CUX1-215ENST00000556210 LY75O60449 1722 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TBL1XO60907 577 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 FKBP9O95302 570 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 CD1EP15812 388 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 GLDCP23378 1020 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-215ENST00000556210 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms