RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 GABRB3P28472 473 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 VIPR1P32241 457 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 DRD3P35462 400 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 P2RY2P41231 377 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 SLC1A2P43004 574 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PDE1BQ01064 536 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CNTN1Q12860 1018 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PEX6Q13608 980 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ARHGEF7Q14155 803 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 SEMA3AQ14563 771 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 STARD3Q14849 445 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FBXO43Q4G163 708 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MROH9Q5TGP6 573 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ARMC3Q5W041 872 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FAM151BQ6UXP7 276 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PACS1Q6VY07 963 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TDRPQ86YL5 185 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TMPRSS6Q8IU80 811 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 SIX5Q8N196 739 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 AADATQ8N5Z0 425 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FLCNQ8NFG4 579 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 OR2T3Q8NH03 318 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 OR4L1Q8NH43 312 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PGM2Q96G03 612 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FOXQ1Q9C009 403 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MFSD1Q9H3U5 465 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FETUBQ9UGM5 382 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CD84Q9UIB8 345 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 A0A1W2PP55 124 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 A0A1W2PPM1 405 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 HMX2A2RU54 273 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 HAUS5O94927 633 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 AHSGP02765 367 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CREB1P16220 341 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 KRT15P19012 456 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MC4RP32245 332 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CA5AP35218 305 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 NEK3P51956 506 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 XIAPP98170 497 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RALGDSQ12967 914 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 E2F5Q15329 346 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ERAP2Q6P179 960 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ZNF449Q6P9G9 518 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CNTN4Q8IWV2 1026 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 GPR26Q8NDV2 337 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PEX13Q92968 403 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CD248Q9HCU0 757 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 IL26Q9NPH9 171 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MED4Q9NPJ6 270 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TXNDC16Q9P2K2 825 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 WNT16Q9UBV4 365 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MUTYHQ9UIF7 546 aa10.19□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TTC28Q96AY4 2481 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 FAM170BA6NMN3 283 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 NEMP1O14524 444 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PSMA3P25788 255 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 MMP12P39900 470 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 GP5P40197 560 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 HADHAP40939 763 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ETV3P41162 512 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PGGT1BP53609 377 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PRKCQQ04759 706 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 LIPIQ6XZB0 460 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 Q6ZVL8 140 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 DPPA4Q7L190 304 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CROCCP2Q86T23 111 aa10.18□□□□□ -0.78
SRP54-208ENST00000555557 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms