RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SEMA7A	O75326	666 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	FTCD	O95954	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	KRT1	P04264	644 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	AMPD1	P23109	780 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ABL2	P42684	1182 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RABIF	P47224	123 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PEX5	P50542	639 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PFN3	P60673	137 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	GNA12	Q03113	381 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NAT6	Q93015	286 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	FPGT	O14772	594 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ALOX15B	O15296	676 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RAMP2	O60895	175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ADRB3	P13945	408 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	GNLY	P22749	145 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CCKBR	P32239	447 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	IGFALS	P35858	605 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ETFB	P38117	255 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RPIA	P49247	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NDST2	P52849	883 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TAZ	Q16635	292 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NPW	Q8N729	165 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ALG3	Q92685	438 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NKD1	Q969G9	470 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	VPS51	Q9UID3	782 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ACVRL1	P37023	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CDKN2B	P42772	138 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PARP15	Q460N3	678 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19

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