RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 XRCC4Q13426 336 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 GALNT3Q14435 633 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 NOMO1Q15155 1222 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 PCSK7Q16549 785 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 ACTL9Q8TC94 416 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 OR1E3Q8WZA6 343 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 PDXPQ96GD0 296 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 LYSMD1Q96S90 227 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 TEX101Q9BY14 249 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 ABCG8Q9H221 673 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 FGF22Q9HCT0 170 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.83■■□□□ 1.09
PUS1-211ENST00000544662 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TPP1O14773 563 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MYF5P13349 255 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 NFKB1P19838 968 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CDK18Q07002 472 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CDKN3Q16667 212 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ZNF567Q8N184 647 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 VAT1Q99536 393 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 DGKBQ9Y6T7 804 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 U3KQA8 63 aa21.82■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 LMO7DNF2Z398 122 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TNFRSF10CO14798 259 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 PMPCBO75439 489 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TNFP01375 233 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ANXA6P08133 673 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 C1QTNF9P0C862 333 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CDK4P11802 303 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CKMT1AP12532 417 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CTSEP14091 401 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TEAD1P28347 426 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 DPTQ07507 201 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ILKQ13418 452 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ELOCQ15369 112 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TCEA2Q15560 299 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 PID1Q7Z2X4 250 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 GATA6Q92908 595 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 SCAMP4Q969E2 229 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 AP2M1Q96CW1 435 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 UBP1Q9NZI7 540 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.81■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 YY2O15391 372 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 TJP3O95049 919 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 RBL1P28749 1068 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 GPR1P46091 355 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CDK3Q00526 305 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 NRSN1Q8IZ57 195 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 USP29Q9HBJ7 922 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.8■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 F5H423 210 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 KRT86O43790 486 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 NDST3O95803 873 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 SOD1P00441 154 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CLDN6P56747 220 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 KDELC1Q6UW63 502 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 NLRP8Q86W28 1048 aa21.79■■□□□ 1.08
PUS1-211ENST00000544662 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms