RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RLN3	Q8WXF3	142 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CDH19	Q9H159	772 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0U1RQS6	177 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PQU0	124 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AURKA	O14965	403 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TSHR	P16473	764 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NMBR	P28336	390 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	HOXA6	P31267	233 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	STX2	P32856	288 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ACSL1	P33121	698 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SPINT3	P49223	89 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FNTB	P49356	437 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R38	P59533	333 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PTS	Q03393	145 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CRYM	Q14894	314 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SNX19	Q92543	992 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CDKL2	Q92772	493 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GPR174	Q9BXC1	333 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MEI4	A8MW99	385 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PRR33	A8MZF0	331 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PFDN6	O15212	129 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SPINT1	O43278	529 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FSBP	O95073	299 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ACSL3	O95573	720 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PYGL	P06737	847 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ITGAL	P20701	1170 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MC4R	P32245	332 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ETV3	P41162	512 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PTPN5	P54829	565 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DCDC1	P59894	354 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CBLB	Q13191	982 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CDKN3	Q16667	212 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51

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