RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 SLC20A1Q8WUM9 679 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL15Q96M94 604 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 NDST4Q9H3R1 872 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 SCINQ9Y6U3 715 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HOXB5P09067 269 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CNTFP26441 200 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GLIPR1P48060 266 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GNAQP50148 359 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HVCN1Q96D96 273 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 KCND2Q9NZV8 630 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PADI1Q9ULC6 663 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PQM1 296 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 POLBP06746 335 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CD53P19397 219 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 BDKRB2P30411 391 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 SORDQ00796 357 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PDE1BQ01064 536 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 NAE1Q13564 534 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 NFE4Q86UQ8 179 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CSTL1Q9H114 145 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TAF1P21675 1872 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TTC36A6NLP5 189 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 USP17L23D6RBM5 183 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 MARK3P27448 753 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GGT5P36269 586 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CDKN1AP38936 164 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CLCN3P51790 818 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-221ENST00000514231 DUX3Q96PT4 197 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FKRPQ9H9S5 495 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-221ENST00000514231 GGA3Q9NZ52 723 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TCF19Q9Y242 345 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.04□□□□□ -1.6
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PDE4D-221ENST00000514231 CGAP01215 116 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT2Q10471 571 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PTP4A2Q12974 167 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 BIRC3Q13489 604 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FAM72BQ86X60 149 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 BBS10Q8TAM1 723 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL29Q96CT2 875 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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PDE4D-221ENST00000514231 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 GAB2Q9UQC2 676 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 IFNL4K9M1U5 179 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CAPN9O14815 690 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FTCDO95954 541 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CDAP32320 146 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 TIMP3P35625 211 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CPOXP36551 454 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PAFAH1B1P43034 410 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FASLGP48023 281 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 FMO5P49326 533 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HILS1P60008 231 aa5.03□□□□□ -1.6
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