RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 PAF1Q8N7H5 531 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 TBATAQ96M53 351 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM74Q96NL1 305 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF670Q9BS34 389 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 LRRC61Q9BV99 259 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 NOD2Q9HC29 1040 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 PISDQ9UG56 409 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 OR1A2Q9Y585 309 aa13.72□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 A8MX80 341 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 TOR1BO14657 336 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 CPP00450 1065 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 ELFN1P0C7U0 828 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 HGFP14210 728 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 GARSP41250 739 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 MMP13P45452 471 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 GALNT2Q10471 571 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 INPP5AQ14642 412 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 MESDQ14696 234 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 MARC1Q5VT66 337 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 KCTD16Q68DU8 428 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 VASH2Q86V25 355 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 PELI3Q8N2H9 469 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 ARL10Q8N8L6 244 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 KCTD6Q8NC69 237 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 FAF2Q96CS3 445 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 APOOQ9BUR5 198 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 FOXP3Q9BZS1 431 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 CLPBQ9H078 707 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 NT5MQ9NPB1 228 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 GULP1Q9UBP9 304 aa13.71□□□□□ -0.21
CHTF18-212ENST00000493715 CFAP69A5D8W1 941 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SOCS5O75159 536 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 KRT7P08729 469 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 CCKBRP32239 447 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 MAN1A1P33908 653 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PEX5P50542 639 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PPARDQ03181 441 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 GBE1Q04446 702 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 MTM1Q13496 603 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 NFATC4Q14934 902 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PDK2Q15119 407 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRRQ15256 657 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TCEA2Q15560 299 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 CNGA3Q16281 694 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 ALG11Q2TAA5 492 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 FAXCQ5TGI0 409 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 BBS5Q8N3I7 341 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TEX26Q8N6G2 289 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PQLC3Q8N755 202 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TC2NQ8N9U0 490 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SPOCK2Q92563 424 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 RAPGEF5Q92565 580 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC42Q96M95 316 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 ADNPQ9H2P0 1102 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 YY2O15391 372 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TSHRP16473 764 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 LHCGRP22888 699 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 VIPR1P32241 457 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 BLKP51451 505 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 HK3P52790 923 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 ENPP7Q6UWV6 458 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 HID1Q8IV36 788 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 KYQ8NBH2 561 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SPC24Q8NBT2 197 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 MAML1Q92585 1016 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM159Q96B96 161 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 PDXPQ96GD0 296 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 COQ10AQ96MF6 247 aa13.69□□□□□ -0.22
CHTF18-212ENST00000493715 SIRPGQ9P1W8 387 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms