RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DQB2P05538 268 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 TPM3P06753 285 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 KRT7P08729 469 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 NIPAL4Q0D2K0 466 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM14Q14142 442 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 USP45Q70EL2 814 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 TAF8Q7Z7C8 310 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 FAM46DQ8NEK8 389 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 HDAC11Q96DB2 347 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD10Q9NUJ1 306 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 DTLQ9NZJ0 730 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 AMACRQ9UHK6 382 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 APPL1Q9UKG1 709 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB3-211ENST00000490677 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 D6RAR5 112 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 KDELR1P24390 212 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 PTSQ03393 145 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC66Q68CR7 880 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 OR6C4Q8NGE1 309 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35G2Q8TBE7 412 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 RNF157Q96PX1 679 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ABCG8Q9H221 673 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LCMT1Q9UIC8 334 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MFAP3LO75121 409 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MTA2O94776 668 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CCNB1P14635 433 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 NFKBIAP25963 317 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 C14orf28Q4W4Y0 310 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 PLD5Q8N7P1 536 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LGMNQ99538 433 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LRRN3Q9H3W5 708 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 RNF215Q9Y6U7 377 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC187A0A096LP49 1063 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CBFA2T2O43439 604 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MMP2P08253 660 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 PNLIPP16233 465 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 GLB1P16278 677 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 POLD2P49005 469 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ITKQ08881 620 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF7Q14155 803 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MESDQ14696 234 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC14AQ86T13 490 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 THSD1Q9NS62 852 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SPTLC3Q9NUV7 552 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CD84Q9UIB8 345 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SUFUQ9UMX1 484 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CHKBQ9Y259 395 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF487B1APH4 448 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 B4DGG1 531 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CES1P23141 567 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 STC1P52823 247 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 RAET1GQ6H3X3 334 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SPRED1Q7Z699 444 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 NLRP8Q86W28 1048 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CCNJLQ8IV13 435 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CNTD1Q8N815 330 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SCAMP4Q969E2 229 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP2Q99490 1192 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 FOXP3Q9BZS1 431 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 MOSPD1Q9UJG1 213 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CAPN8A6NHC0 703 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 AKR1B10O60218 316 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 FGF1P05230 155 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF30P17039 623 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 CCKBRP32239 447 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 FAM182AQ5T1J6 154 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 SLC9A4Q6AI14 798 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF765Q7L2R6 523 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 WDR24Q96S15 920 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 LYSMD1Q96S90 227 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 DPEP2Q9H4A9 486 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB3-211ENST00000490677 DEF6Q9H4E7 631 aa27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154 ms