RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 TMC8Q8IU68 726 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FRMD1Q8N878 549 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RLN3Q8WXF3 142 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FGF11Q92914 225 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SMARCD2Q92925 531 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SCLT1Q96NL6 688 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MARCH5Q9NX47 278 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SVILO95425 2214 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 E9PAM4 449 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ATP9AO75110 1047 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 EGFP01133 1207 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SERPINF2P08697 491 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CLDN6P56747 220 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 HSF1Q00613 529 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 DMC1Q14565 340 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 USP41Q3LFD5 358 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 DHRS13Q6UX07 377 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 GLRX5Q86SX6 157 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CEP76Q8TAP6 659 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MBOAT7Q96N66 472 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PCYT2Q99447 389 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FNIP2Q9P278 1114 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MED13LQ71F56 2210 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 AKAP9Q99996 3911 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PDZD2O15018 2839 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 NID2Q14112 1375 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CHADO15335 359 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CCP110O43303 1012 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CBFA2T3O75081 653 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 POLR2MP0CAP2 368 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 GJA1P17302 382 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PTPN2P17706 415 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 HOXA9P31269 272 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 IGFBP7Q16270 282 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CEP57Q86XR8 500 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MAML1Q92585 1016 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SPSB4Q96A44 273 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MED13Q9UHV7 2174 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RGS10O43665 173 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 STAM2O75886 525 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RASAL1O95294 804 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.441e-10■■■□□ 17.2
RBM39-232ENST00000481037 ACTN2P35609 894 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 DPP6P42658 865 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 CLCN3P51790 818 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 UCNP55089 124 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 YPEL5P62699 121 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 NPY5RQ15761 445 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FUT10Q6P4F1 479 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 SYT13Q7L8C5 426 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 OR56A3Q8NH54 315 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 HIC2Q96JB3 615 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 AIFM3Q96NN9 605 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-232ENST00000481037 FNBP1Q96RU3 617 aa6.05□□□□□ -1.44
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