RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479023.5

FGD4-205, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 4

Gene FGD4, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-205	ENST00000479023		A0A0G2JPF8	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023		H7C0S8	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	STX16	O14662	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SEPT4	O43236	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HADHA	P40939	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ATP5O	P48047	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	AP1B1	Q10567	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SCARB2	Q14108	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	DHX58	Q96C10	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	BECN2	A8MW95	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SLITRK3	O94933	977 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HSPA4L	O95757	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	OPN1MW	P04001	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	AKR1B1	P15121	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF3	P17036	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CHRNB2	P17787	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ITGB6	P18564	788 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RXRA	P19793	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SOX6	P35712	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	THBS3	P49746	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	RASSF2	P50749	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SELENOV	P59797	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ACTR2	P61160	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GRIK3	Q13003	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CDC16	Q13042	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	PPA1	Q15181	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	DPP10	Q8N608	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	SHC3	Q92529	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-205	ENST00000479023	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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