RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NRSN1Q8IZ57 195 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GPR156Q8NFN8 814 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 DEPDC7Q96QD5 511 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CHKBQ9Y259 395 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 A0A087WV48 116 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PRSS38A1L453 326 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CPED1A4D0V7 1026 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TCEA3O75764 348 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CEACAM5P06731 702 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PYGLP06737 847 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TGM2P21980 687 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SPA17Q15506 151 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PERM1Q5SV97 790 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 MAPK15Q8TD08 544 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SMIM14Q96QK8 99 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TRIB3Q96RU7 358 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ABCG8Q9H221 673 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RP1P56715 2156 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 LAMA5O15230 3695 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NDUFA10O95299 355 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 FUCA1P04066 466 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 EPHB1P54762 984 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NPNTQ6UXI9 565 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RFX6Q8HWS3 928 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ABCG4Q9H172 646 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SLC25A51Q9H1U9 297 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RAXQ9Y2V3 346 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RGSL1A5PLK6 1076 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 DXOO77932 396 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CD86P42081 329 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 AP1B1Q10567 949 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 QPCTQ16769 361 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ISXQ2M1V0 245 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 KYQ8NBH2 561 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 AP2M1Q96CW1 435 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CYP4F12Q9HCS2 524 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GPR34Q9UPC5 381 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 IVLP07476 585 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TEX44Q53QW1 395 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ODF2Q5BJF6 829 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 DENND2CQ68D51 928 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 EXD1Q8NHP7 514 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 COX14Q96I36 57 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0U1RQS6 177 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RCCD1A6NED2 376 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NOBOXO60393 691 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CST8O60676 142 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CSO75390 466 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PNLIPP16233 465 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 PPP2R5EQ16537 467 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 RAET1GQ6H3X3 334 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TEKT5Q96M29 485 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 WDR24Q96S15 920 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 APPL1Q9UKG1 709 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 TFR2Q9UP52 801 aa23.34■■□□□ 1.33
C9orf3-215ENST00000478473 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms