RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 PNCKQ6P2M8 343 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 KDELC1Q6UW63 502 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 OR4C6Q8NH72 309 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PDXPQ96GD0 296 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 WDR92Q96MX6 357 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 LGR4Q9BXB1 951 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CD84Q9UIB8 345 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.07□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 F5H423 210 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ENC1O14682 589 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 SIGLEC6O43699 453 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PMPCBO75439 489 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CLDN7O95471 211 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TSHRP16473 764 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HTR1BP28222 390 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ACADVLP49748 655 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 DPTQ07507 201 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 DNAJC3Q13217 504 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PROX2Q3B8N5 592 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TBATAQ96M53 351 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GBA3Q9H227 469 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 WDR26Q9H7D7 661 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 FGF22Q9HCT0 170 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 UBP1Q9NZI7 540 aa14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 SPTBP11277 2137 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TMEM202A6NGA9 273 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 SCAMP1O15126 338 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 AQP9O43315 295 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 NRDCO43847 1150 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GCATO75600 419 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 NDST3O95803 873 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PIRTP0C851 137 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TEAD1P28347 426 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 HK3P52790 923 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CDK3Q00526 305 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PPARDQ03181 441 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CDK18Q07002 472 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 PID1Q7Z2X4 250 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 SCAMP4Q969E2 229 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 AP2M1Q96CW1 435 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 EID2BQ96D98 161 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 FCRL5Q96RD9 977 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TEX101Q9BY14 249 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CLPBQ9H078 707 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ABCG8Q9H221 673 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 KLQ9UEF7 1012 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ZNF711Q9Y462 761 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 SDK2Q58EX2 2172 aa14.05□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.04□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.04□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.04□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.04□□□□□ -0.16
SRRT-210ENST00000477529 NEMP2A6NFY4 417 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms