RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC66	A2RUB6	948 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CAPN8	A6NHC0	703 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PSMD11	O00231	422 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	YY2	O15391	372 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FZD6	O60353	706 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN7	O95471	211 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PROS1	P07225	676 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	C1S	P09871	688 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PIRT	P0C851	137 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CDK4	P11802	303 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GM2A	P17900	193 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RPIA	P49247	311 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RWDD2B	P57060	319 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1024L	P59773	190 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ADCY2	Q08462	1091 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	IHH	Q14623	411 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	NR0B2	Q15466	257 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GKN2	Q86XP6	184 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PELI3	Q8N2H9	469 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	IFI44	Q8TCB0	444 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CLPB	Q9H078	707 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GLOD4	Q9HC38	313 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FGF22	Q9HCT0	170 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0U1RQJ8	604 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	LMO7DN	F2Z398	122 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	INPP4B	O15327	924 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	KRT37	O76014	449 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ASMTL	O95671	621 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	FTCD	O95954	541 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MMP2	P08253	660 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GIMD1	P0DJR0	217 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CKMT1A	P12532	417 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF30	P17039	623 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	NFKB1	P19838	968 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ACP1	P24666	158 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PTPN3	P26045	913 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GSDMD	P57764	484 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ILK	Q13418	452 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	QPCT	Q16769	361 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	TEX44	Q53QW1	395 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PID1	Q7Z2X4	250 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM74	Q86UV6	250 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM139	Q8IV31	216 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK15	Q8TD08	544 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SPOCK2	Q92563	424 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SCAMP4	Q969E2	229 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	ABCG8	Q9H221	673 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	GPR34	Q9UPC5	381 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS38	A1L453	326 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	PJA2	O43164	708 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	MTSS1	O43312	755 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	GNPDA1	P46926	289 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	POLD2	P49005	469 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	COPS2	P61201	443 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	CDK3	Q00526	305 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	E2F1	Q01094	437 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	14.77	□□□□□ -0.05
SSR4-208	ENST00000471880	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05

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