RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 O00370 1275 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TEX33O43247 280 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 GSRP00390 522 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV3-25P01717 112 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 VDRP11473 427 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 OR1E1P30953 314 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TSFMP43897 325 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 GCLMP48507 274 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 LIG3P49916 1009 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 NEK4P51957 841 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 EPHA4P54764 986 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ANAPC15P60006 121 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 HHEXQ03014 270 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 FOLH1Q04609 750 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 NFATC2Q13469 925 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 C5orf22Q49AR2 442 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ALFQ53S48 1182 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 MR1Q95460 341 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 SH3KBP1Q96B97 665 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 HMCESQ96FZ2 354 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 HSFY1Q96LI6 401 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf72Q96LT7 481 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 SIK2Q9H0K1 926 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 PDE7BQ9NP56 450 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.29□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0U1RQS6 177 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ZMPSTE24O75844 475 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 RHOBTB3O94955 611 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 HEXAP06865 529 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM23P36406 574 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ARF5P84085 180 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 RAD51Q06609 339 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ATP1A4Q13733 1029 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 CEBPEQ15744 281 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ERAP2Q6P179 960 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 BCORP1Q8N888 145 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 CLEC1AQ8NC01 280 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 COG1Q8WTW3 980 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 NRGNQ92686 78 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 C18orf12Q96KH6 178 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 PANK2Q9BZ23 570 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 DDIT4Q9NX09 232 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 SUFUQ9UMX1 484 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 SEC16AO15027 2179 aa13.28□□□□□ -0.28
C9orf3-211ENST00000463372 M0QYV0 167 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 RASSF9O75901 435 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TIAF1O95411 115 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CA5AP35218 305 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM207Q6UWW9 146 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 GFRALQ6UXV0 394 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 GALNT16Q8N428 558 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 SFRP1Q8N474 314 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 EEF2KMTQ96G04 330 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC88CQ9P219 2028 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ILVBLA1L0T0 632 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 MASP2O00187 686 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CREB3O43889 395 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PAGE1O75459 146 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CEACAM5P06731 702 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 INHBBP09529 407 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PCSK6P29122 969 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 HIVEP2P31629 2446 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ADCY8P40145 1251 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CA7P43166 264 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 GFERP55789 205 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 YBX1P67809 324 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ADAM8P78325 824 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CDK17Q00537 523 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 DSG2Q14126 1118 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 FAAH2Q6GMR7 532 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF783Q6ZMS7 281 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms