RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 Q9UFV3 132 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SIX4Q9UIU6 781 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.5□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 A0A1W2PPC4 97 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 C10orf142B7Z368 130 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TLR4O00206 839 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 KLRC4O43908 158 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 EXOC3O60645 756 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ATP2C2O75185 946 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 VPS4BO75351 444 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 NEBLO76041 1014 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 RHOBTB3O94955 611 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 DDAH2O95865 285 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 IRF1P10914 325 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ACADMP11310 421 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CKMT1AP12532 417 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TYRP14679 529 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 COMTP21964 271 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CD38P28907 300 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 UGT1A5P35504 534 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 IGFALSP35858 605 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ACVRL1P37023 503 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ETV5P41161 510 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SYKP43405 635 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PPP3CCP48454 512 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 KIF11P52732 1056 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 BCAT1P54687 386 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 RPS14P62263 151 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CYP24A1Q07973 514 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SQSTM1Q13501 440 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CUL4BQ13620 913 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ENPP2Q13822 863 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PKP1Q13835 747 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ZNF234Q14588 700 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ZNF460Q14592 562 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CDSNQ15517 529 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 AGBL4Q5VU57 503 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TMEM215Q68D42 235 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 GUSBP11Q6P575 273 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 USP30Q70CQ3 517 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 FUKQ8N0W3 1084 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TTC39CQ8N584 583 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 IFI44Q8TCB0 444 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 DLG3Q92796 817 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SAAL1Q96ER3 474 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 HPDLQ96IR7 371 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 SPATA17Q96L03 361 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 LURAP1Q96LR2 239 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 APOLD1Q96LR9 279 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 ABCG4Q9H172 646 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 LHX5Q9H2C1 402 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 GDF3Q9NR23 364 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 EXOC1Q9NV70 894 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 CDH9Q9ULB4 789 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 VPS4AQ9UN37 437 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 L1RE1Q9UN81 338 aa4.49□□□□□ -1.69
CNN3-204ENST00000461018 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms