RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD8	P48556	350 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SCNN1B	P51168	640 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHB1	P54762	984 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SESN3	P58005	492 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DLG1	Q12959	904 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	COQ5	Q5HYK3	327 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ISCA2	Q86U28	154 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NDN	Q99608	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OLFM1	Q99784	485 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	POMP	Q9Y244	141 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758		H3BNC9	293 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CBX4	O00257	560 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF3C	O14782	793 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	AIM2	O14862	343 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB14	O43829	449 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SOCS5	O75159	536 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CRCP	O75575	148 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT34	O76011	436 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	BAG2	O95816	211 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C1R	P00736	705 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GFAP	P14136	432 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC6A4	P31645	630 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNQ1	P51787	676 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	IL2	P60568	153 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNG1	Q06432	222 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LCP2	Q13094	533 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CDH18	Q13634	790 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF460	Q14592	562 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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