RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 MMP13P45452 471 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IFNAR2P48551 515 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GPR15P49685 360 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RABGGTBP53611 331 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IL2P60568 153 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PDE1BQ01064 536 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GBE1Q04446 702 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SULT2A1Q06520 285 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RAD51Q06609 339 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CDH17Q12864 832 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MPP3Q13368 585 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SEMA5AQ13591 1074 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC29A2Q14542 456 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF235Q14590 738 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SHHQ15465 462 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC142Q17RM4 750 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 C5orf22Q49AR2 442 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CES5AQ6NT32 575 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FBXL22Q6P050 247 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NPNTQ6UXI9 565 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 AHI1Q8N157 1196 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CPXM2Q8N436 756 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EFHBQ8N7U6 833 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 DDI1Q8WTU0 396 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 USP7Q93009 1102 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 OLFM3Q96PB7 478 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 LGMNQ99538 433 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CENPHQ9H3R5 247 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 TDP1Q9NUW8 608 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 OSER1Q9NX31 292 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MYH10P35580 1976 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A1W2PQ67 120 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT19A8MXV4 375 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RASA4BC9J798 803 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM72CH0Y354 149 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CCL16O15467 120 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RIPK2O43353 540 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RASA4O43374 803 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 KDELR3O43731 214 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MAFKO60675 156 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 KRT38O76015 456 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 STC2O76061 302 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EPOP01588 193 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CA3P07451 260 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 RHOCP08134 193 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SERPINF2P08697 491 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GLI4P10075 376 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 CNTFP26441 200 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 HADHAP40939 763 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 MSH2P43246 934 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 EPHA5P54756 1037 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 GNA12Q03113 381 aa5.18□□□□□ -1.58
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms