RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A45Q8N413 288 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PBKQ96KB5 322 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX101Q9BY14 249 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH19Q9H159 772 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCG8Q9H221 673 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TRABDQ9H4I3 376 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF15Q9UIH9 416 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1A2Q9Y585 309 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0U1RQS6 177 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NEMP2A6NFY4 417 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF10CO14798 259 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GIPC1O14908 333 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP104O60308 925 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 JUNDP17535 347 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PPARDQ03181 441 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC1A5Q15758 541 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RANBP10Q6VN20 620 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PELI3Q8N2H9 469 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 IPMKQ8NFU5 416 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 AP2M1Q96CW1 435 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR92Q96MX6 357 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR26Q9H7D7 661 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD18Q9NS91 495 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HACD3Q9P035 362 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM131Q92545 1883 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 K7ESM1 405 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ENC1O14682 589 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SCAMP1O15126 338 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RASGRP1O95267 797 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FGGP02679 453 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF1P05230 155 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMB4P28070 264 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ADRA1AP35348 466 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR1P46091 355 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXK2Q01167 660 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 P3H1Q32P28 736 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FAXCQ5TGI0 409 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC45Q96CN5 670 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 EID2BQ96D98 161 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SPASTQ9UBP0 616 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF711Q9Y462 761 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TPP1O14773 563 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMD3O43242 534 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF14O43557 240 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SDC3O75056 442 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SOD1P00441 154 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GIMD1P0DJR0 217 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CXCR5P32302 372 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HK3P52790 923 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GDF10P55107 478 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK3Q00526 305 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ALG11Q2TAA5 492 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms