RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 U3KQV3 271 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PTGES3LE9PB15 166 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RBP1P09455 135 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGB6P18564 788 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 FUT4P22083 530 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CTBSQ01459 385 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MERTKQ12866 999 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SEMA3BQ13214 749 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PSMD5Q16401 504 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MARC1Q5VT66 337 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TINF2Q9BSI4 451 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 VTA1Q9NP79 307 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DERAQ9Y315 318 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TOR1BO14657 336 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ARPC2O15144 300 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR39O43194 453 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RHOBTB1O94844 696 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGB1P05556 798 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL15Q16663 113 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF112Q9ULX5 631 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MTPNP58546 118 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 STK32CQ86UX6 486 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CARM1Q86X55 608 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PELI3Q8N2H9 469 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NTAN1Q96AB6 310 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCG8Q9H221 673 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP10Q9P2G4 905 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CXCL11O14625 94 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 UNC50Q53HI1 259 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ALFQ53S48 1182 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR142Q7Z601 462 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CMTM6Q9NX76 183 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A087WXM4 84 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQH9 124 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 E9PAM4 449 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AZIN1O14977 448 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM24O15164 1050 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MATN3O15232 486 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CDK14O94921 469 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ALDH4A1P30038 563 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNK10P57789 538 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 UFM1P61960 85 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 HERC3Q15034 1050 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 OR4D1Q15615 310 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXO30Q8TB52 745 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 FCRL5Q96RD9 977 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SEMA3CQ99985 751 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NMUR1Q9HB89 426 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GNGT2O14610 69 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL14Q16627 93 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ISCA2Q86U28 154 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 HS3ST5Q8IZT8 346 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDH12Q9NPG4 1184 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NOBOXO60393 691 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GRK4P32298 578 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CLCN2P51788 898 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms