RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ISL2Q96A47 359 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 OXSMQ9NWU1 459 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TIMM22Q9Y584 194 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 APOL1O14791 398 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SEC14L2O76054 403 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MICAL2O94851 1124 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TGM1P22735 817 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GP5P40197 560 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MPP1Q00013 466 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 OCA2Q04671 838 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 RALGDSQ12967 914 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 STX5Q13190 355 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GRTP1Q5TC63 336 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CYGBQ8WWM9 190 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 DKK3Q9UBP4 350 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRDP23468 1912 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 KCNH1O95259 989 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PIGNO95427 931 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 LTFP02788 710 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 LRP8Q14114 963 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PKDCCQ504Y2 493 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 DHFR2Q86XF0 187 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 XYLT1Q86Y38 959 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 DCLK2Q8N568 766 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 LHX5Q9H2C1 402 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MED7O43513 233 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 EFEMP2O95967 443 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MLNP12872 115 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TYMPP19971 482 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 LHX1P48742 406 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GK5Q6ZS86 529 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 OR2T3Q8NH03 318 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 FBXL20Q96IG2 436 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CLIC3O95833 236 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 TPTEP56180 551 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CRADDP78560 199 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SEMA5AQ13591 1074 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SNX19Q92543 992 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 NRBF2Q96F24 287 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CPNE1Q99829 537 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 RMND5AQ9H871 391 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MID2Q9UJV3 735 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ZBBXA8MT70 800 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K6O95382 1288 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 MPOP05164 745 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 PGAM1P18669 254 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 IL4RP24394 825 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 GPD2P43304 727 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF773Q6PK81 442 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-205ENST00000436404 CSF3RQ99062 836 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms