RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCEAL1Q15170 157 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC66Q68CR7 880 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OGFOD3Q6PK18 319 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SARM1Q6SZW1 724 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOMEZQ8IX15 550 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLD5Q8N7P1 536 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR156Q8NFN8 814 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AP2M1Q96CW1 435 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LGMNQ99538 433 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABCG8Q9H221 673 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DPEP2Q9H4A9 486 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDH9Q9HC56 1237 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.34□□□□□ -0.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A0U1RQS6 177 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPN8A6NHC0 703 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPOPO43791 374 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRLP01236 227 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEACAM5P06731 702 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PYGLP06737 847 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TNNT1P13805 278 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLB1P16278 677 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STC1P52823 247 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTSQ03393 145 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AP1B1Q10567 949 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IHHQ14623 411 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDK1Q15118 436 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF765Q7L2R6 523 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NLRP8Q86W28 1048 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFX6Q8HWS3 928 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMIM14Q96QK8 99 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SATB2Q9UPW6 733 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.33□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 B4DGG1 531 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOBOXO60393 691 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FUCA1P04066 466 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IVLP07476 585 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PNLIPP16233 465 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COMTP21964 271 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITPKBP27987 946 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD86P42081 329 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAGEA1P43355 309 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNPDA1P46926 289 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCL7P80098 99 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBTB17Q13105 803 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NRSN1Q8IZ57 195 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNTD1Q8N815 330 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TC2NQ8N9U0 490 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCAMP4Q969E2 229 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LYSMD1Q96S90 227 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADGRE3Q9BY15 652 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRN3Q9H3W5 708 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THSD1Q9NS62 852 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD84Q9UIB8 345 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 APPL1Q9UKG1 709 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SUFUQ9UMX1 484 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HYOU1Q9Y4L1 999 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.32□□□□□ -0.28
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms