RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PYGBP11216 843 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CD151P48509 253 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PSMD8P48556 350 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TDGQ13569 410 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 IER5LQ5T953 404 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SDE2Q6IQ49 451 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 RHOJQ9H4E5 214 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM120BA0PK00 339 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 HAUS5O94927 633 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 DRD1P21728 446 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 LHCGRP22888 699 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PSMA3P25788 255 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ITGB7P26010 798 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 GABRB3P28472 473 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PMLP29590 882 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 VIPR1P32241 457 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 METAP1P53582 386 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ERAP2Q6P179 960 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 DCLK2Q8N568 766 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ARRDC3Q96B67 414 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 TPP1O14773 563 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 PRSS56P0CW18 603 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SRFP11831 508 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SAT1P21673 171 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 ENPP2Q13822 863 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 SEMA3AQ14563 771 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CACUL1Q86Y37 369 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 CNPY4Q8N129 248 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 GPR150Q8NGU9 434 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 MDM1Q8TC05 714 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-204ENST00000402096 H7C0S8 307 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 RFPL1O75677 317 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 TYK2P29597 1187 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 NTSR1P30989 418 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SERPINB8P50452 374 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC3Q13217 504 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PEX6Q13608 980 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 CNSTQ6PJW8 725 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 GPATCH11Q8N954 259 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 MGARPQ8TDB4 240 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 EYSQ5T1H1 3165 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 F5P12259 2224 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PLK4O00444 970 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 S1PR4O95977 384 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 GLULP15104 373 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 CHN1P15882 459 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF30P17039 623 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 BPIP17213 487 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 FOXN2P32314 431 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SPAM1P38567 509 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PTSQ03393 145 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 STARD3Q14849 445 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 FAM3CQ92520 227 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 PRAMEF1O95521 474 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-204ENST00000402096 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms