RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 POU6F1Q14863 301 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF77Q15935 545 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CNGA3Q16281 694 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 UGP2Q16851 508 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MPPE1Q53F39 396 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HHATQ5VTY9 493 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 IL31Q6EBC2 164 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPRED2Q7Z698 418 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LCA5Q86VQ0 697 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SHISA5Q8N114 240 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DCLK2Q8N568 766 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GPR150Q8NGU9 434 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RIN3Q8TB24 985 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GDAP1Q8TB36 358 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MGARPQ8TDB4 240 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 VOPP1Q96AW1 172 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 VPS39Q96JC1 886 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CABS1Q96KC9 395 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GCNAQ96QF7 691 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SPON2Q9BUD6 331 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NOD2Q9HC29 1040 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 DPP7Q9UHL4 492 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 VPS51Q9UID3 782 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GGT7Q9UJ14 662 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 EMCNQ9ULC0 261 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 H0Y626 953 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CBX4O00257 560 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF197O14709 1029 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TPP1O14773 563 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SNAP91O60641 907 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PLIN3O60664 434 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 XYLBO75191 536 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GLRA3O75311 464 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RFPL2O75678 378 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TMCC1O94876 653 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 VAPBO95292 243 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TGDSO95455 350 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CA3P07451 260 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 BPGMP07738 259 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 COL6A2P12110 1019 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 MYOGP15173 224 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 EPCAMP16422 314 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GJA1P17302 382 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 AP1S1P61966 158 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 ITKQ08881 620 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 LMAN2Q12907 356 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 TEAD2Q15562 447 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 GPR158Q5T848 1215 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 NEPROQ6NW34 567 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms