RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MFN1Q8IWA4 741 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FAM47BQ8NA70 645 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 UROC1Q96N76 676 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PLK2Q9NYY3 685 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PRSS56P0CW18 603 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGEF7Q14155 803 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MS4A13Q5J8X5 152 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 DDI1Q8WTU0 396 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 THAP11Q96EK4 314 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 LINGO1Q96FE5 620 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 KATNBL1Q9H079 304 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ACTL7AQ9Y615 435 aa10.6□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CLOCKO15516 846 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MAP3K13O43283 966 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MGEA5O60502 916 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NCK1P16333 377 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 HLA-DPA1P20036 260 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 TACR2P21452 398 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MC4RP32245 332 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RGS4P49798 205 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SEMG2Q02383 582 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PRKCZQ05513 592 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SREBF2Q12772 1141 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RGMBQ6NW40 437 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FIG4Q92562 907 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SUSD3Q96L08 255 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 DHRS12A0PJE2 317 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CCDC189A1A4V9 331 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SLC7A4O43246 635 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ALBP02768 609 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CKMP06732 381 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ATP6V1B2P21281 511 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 AKT1P31749 480 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 OR1D2P34982 312 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 HK2P52789 917 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PM20D1Q6GTS8 502 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 IGSF8Q969P0 613 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ZFP14Q9HCL3 533 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 GKN1Q9NS71 199 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 A0A0D9SEW6 157 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SH3BGRLO75368 114 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 GJB3O75712 270 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PGFP49763 221 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 USP46P62068 366 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PHEXP78562 749 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SATB1Q01826 763 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 LPIN1Q14693 890 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NEDD8Q15843 81 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 KDM1BQ8NB78 822 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NT5C3BQ969T7 300 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CDK15Q96Q40 435 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 RHBDL2Q9NX52 303 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 GABRQQ9UN88 632 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PDLIM1O00151 329 aa10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 CLCQ05315 142 aa10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 SCD5Q86SK9 330 aa10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 FAM162AQ96A26 154 aa10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.58□□□□□ -0.71
ZNF549-202ENST00000376233 PPM1MQ96MI6 270 aa10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms