RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 TUSC3Q13454 348 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SQLEQ14534 574 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MAPRE2Q15555 327 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 AFMIDQ63HM1 303 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 EXT2Q93063 718 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HDAC10Q969S8 669 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HMCESQ96FZ2 354 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB11Q96P15 392 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ALG9Q9H6U8 611 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SP110Q9HB58 689 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF10BO14763 440 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SUPT7LO94864 414 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 C21orf59P57076 290 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 IKBKEQ14164 716 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ACAP2Q15057 778 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 GPR158Q5T848 1215 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 REP15Q6BDI9 236 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ARL10Q8N8L6 244 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 THAP11Q96EK4 314 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ADAM2Q99965 735 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 OSER1Q9NX31 292 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CRYL1Q9Y2S2 319 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 OR51F1A6NGY5 319 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6AP2O75787 350 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 BMP10O95393 424 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CD247P20963 164 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ETFBP38117 255 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TMED10P49755 219 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 RALGDSQ12967 914 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PSMD5Q16401 504 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ARTNQ5T4W7 220 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CHSY3Q70JA7 882 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 LRTOMTQ8WZ04 291 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ASB9Q96DX5 294 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SLC29A1Q99808 456 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HEPHQ9BQS7 1158 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CNTN5O94779 1100 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF12P17014 697 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UGT1A6P19224 532 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UGT1A1P22309 533 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UGT1A4P22310 534 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UGT1A3P35503 534 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UGT1A5P35504 534 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CDKN2DP55273 166 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP1BP68106 108 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TUBA4AP68366 448 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf87Q6PH81 154 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC80Q76M96 950 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HMGCLL1Q8TB92 370 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf50Q8WW18 174 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 VPS45Q9NRW7 570 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 AP4S1Q9Y587 144 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD3Q9Y597 815 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CENPFP49454 3210 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 J3QRK9 145 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms