RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 KRBA1A5PL33 1030 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 AGRPO00253 132 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SYN3O14994 580 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TYMPP19971 482 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CCNA2P20248 432 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SOX11P35716 441 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKCQQ04759 706 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PRPSAP1Q14558 356 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NUMA1Q14980 2115 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CLOCKO15516 846 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ITGB1P05556 798 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CKMP06732 381 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 LAG3P18627 525 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NR4A1P22736 598 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CCR1P32246 355 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PPM1AP35813 382 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 EPHB3P54753 998 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ITPKCQ96DU7 683 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC138Q96M89 665 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SYBUQ9NX95 663 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 OGDHLQ9ULD0 1010 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.2□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TGM2P21980 687 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 GABRB3P28472 473 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PLCL1Q15111 1095 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 STARD8Q92502 1023 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TFAP2CQ92754 450 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CDH7Q9ULB5 785 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 A8MU76 341 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM114B3SHH9 223 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 G3V2L1 256 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SOAT2O75908 522 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 MT-CO1P00395 513 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC2A3P11169 496 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 GLUD2P49448 558 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NME5P56597 212 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 MGAT3Q09327 533 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 AGKQ53H12 422 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TBCELQ5QJ74 424 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TCF12Q99081 682 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 F8W810 466 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 H0YJX3 145 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 USP12O75317 370 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 PMPCBO75439 489 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 C8BP07358 591 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 ARSAP15289 507 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TPSB2P20231 275 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC7A1P30825 629 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 RCVRNP35243 200 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 AVPR1AP37288 418 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 MAGEA3P43357 314 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 FPGSQ05932 587 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 NFATC3Q12968 1075 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 OLIG2Q13516 323 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TCEA2Q15560 299 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 TPSAB1Q15661 275 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.19□□□□□ -0.62
RPRD1B-201ENST00000373433 CERS2Q96G23 380 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms