RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 LGI2Q8N0V4 545 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 NETO2Q8NC67 525 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 USP7Q93009 1102 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 MED28Q9H204 178 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PLK2Q9NYY3 685 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 H7C4K7 107 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 TTPAP49638 278 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 JAM2P57087 298 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 HELQQ8TDG4 1101 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 HDAC10Q969S8 669 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 EBF4Q9BQW3 602 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR18Q9BV38 432 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 C9P02748 559 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 THPOP40225 353 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PHC1P78364 1004 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 BNIP3Q12983 259 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 REPS2Q8NFH8 660 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP1R14AQ96A00 147 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PHF11Q9UIL8 331 aa18.59■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 LRATO95237 230 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 ASLP04424 464 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 CYP4F8P98187 520 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 LENG9Q96B70 501 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 EPORP19235 508 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 SDC2P34741 201 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKAG1P54619 331 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 ZBED5Q49AG3 693 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PIGZQ86VD9 579 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM84AQ96KN4 292 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.58■□□□□ 0.57
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKD3O94806 890 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 GALNT3Q14435 633 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCG8Q9H221 673 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGS2P35354 604 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 GNA12Q03113 381 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PIK3R3Q92569 461 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TMCO6Q96DC7 493 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.58■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEA3O75764 348 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 CATP04040 527 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 DLG1Q12959 904 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MST1RQ04912 1400 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ECDO95905 644 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MTA1Q13330 715 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 LCN1P1Q5VSP4 162 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 COPS4Q9BT78 406 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS4AQ9UN37 437 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF280DQ6N043 979 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 SGTAO43765 313 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 BDNFP23560 247 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 HNF4AP41235 474 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MADCAM1Q13477 382 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ELOVL7A1L3X0 281 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MDM4O15151 490 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TP73O15350 636 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL2L1Q07817 233 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 CYP2A13Q16696 494 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ROPN1LQ96C74 230 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TOR3AQ9H497 397 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 ASB8Q9H765 288 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TULP3O75386 442 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 TNFSF9P41273 254 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 LIMK2P53671 638 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 MERTKQ12866 999 aa18.56■□□□□ 0.56
AMIGO1-202ENST00000369864 CYP1B1Q16678 543 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms