RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367094.6

TULP4-201, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP4, Length 5,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-201ENST00000367094 CNTD1Q8N815 330 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SUSD6Q92537 303 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 VMP1Q96GC9 406 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 BBS4Q96RK4 519 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 FNIP2Q9P278 1114 aa10.2□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HIST1H2ABP04908 130 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 GJB1P08034 283 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SLURP2P0DP57 97 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PLCL1Q15111 1095 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CHADLQ6NUI6 762 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 DENND1CQ8IV53 801 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SCAIQ8N9R8 606 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TRPV3Q8NET8 790 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 STYXQ8WUJ0 223 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ELMO1Q92556 727 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HIST1H2ACQ93077 130 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 MPP4Q96JB8 637 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 MNTQ99583 582 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CCDC182A6NF36 153 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 GPR25O00155 361 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 LGR5O75473 907 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 C2P06681 752 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HGFP14210 728 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 GLUD2P49448 558 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 STARP49675 285 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 BROXQ5VW32 411 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CHPFQ8IZ52 775 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ITCHQ96J02 903 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TTPALQ9BTX7 342 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CLN6Q9NWW5 311 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 NDST3O95803 873 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ADSSP30520 456 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ASPAP45381 313 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 RFX3P48380 749 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 NOGQ13253 232 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ATP1A4Q13733 1029 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PDK3Q15120 406 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 C5orf22Q49AR2 442 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 C11orf74Q86VG3 221 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TMEM199Q8N511 208 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CXorf40AQ8TE69 158 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 LPPQ93052 612 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HDAC10Q969S8 669 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 NTAN1Q96AB6 310 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 MATN3O15232 486 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 AVILO75366 819 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 KRT36O76013 467 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TSC22D1Q15714 1073 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 CUZD1Q86UP6 607 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 RFT1Q96AA3 541 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 HPS4Q9NQG7 708 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 DKK3Q9UBP4 350 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 FZD10Q9ULW2 581 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.19□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 A0A0X1KG70 313 aa10.18□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 TM7SF2O76062 418 aa10.18□□□□□ -0.78
TULP4-201ENST00000367094 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms