RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ATP12AP54707 1039 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GPAT3Q53EU6 434 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4X1Q8N118 509 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PLK2Q9NYY3 685 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GLTPD2A6NH11 291 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 H0Y858 1186 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LILRA4P59901 499 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RINLQ6ZS11 566 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GBA3Q9H227 469 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS2O75306 463 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 BMP7P18075 431 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TACR2P21452 398 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 STYXQ8WUJ0 223 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RTKNQ9BST9 563 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 22.2
CCSAP-203ENST00000366687 MYDGFQ969H8 173 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KIF1AQ12756 1690 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLIT3O75094 1523 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LRIG2O94898 1065 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MTAPQ13126 283 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TAB1Q15750 504 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DEC1Q9P2X7 70 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ELNP15502 786 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF607Q96SK3 696 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SDCBP2Q9H190 292 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 IL6P05231 212 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KLF10Q13118 480 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GPR158Q5T848 1215 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CHSY3Q70JA7 882 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PPCDCQ96CD2 204 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AP3D1O14617 1153 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A2P23975 617 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GNPDA1P46926 289 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 EML3Q32P44 896 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf64Q86WR6 236 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PROSER1Q86XN7 944 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ASNA1O43681 348 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PHC3Q8NDX5 983 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CDK14O94921 469 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LRATO95237 230 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DLG2Q15700 870 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SMYD1Q8NB12 490 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T12Q8NG77 320 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf26Q96N11 449 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A7Q96T83 725 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA2Q9UM82 520 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YYE9 177 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B4P06133 528 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MPSTP25325 297 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CLCNKBP51801 687 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms