RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLPTM1O96005 669 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINC1P01008 464 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYC1P08574 325 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM49P0CI25 452 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM49CP0CI26 452 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHN1P15882 459 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF32P17041 273 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITIH1P19827 911 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFKBIAP25963 317 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RYKP34925 604 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRIM2P49643 509 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDK7P50613 346 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MVDP53602 400 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCTN1Q14203 1278 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GBX1Q14549 363 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL13RA2Q14627 380 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF6Q15052 776 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPB2Q16082 182 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALNTL6Q49A17 601 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO43Q4G163 708 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC24Q50LG9 513 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2CD6Q53TS8 623 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM102BQ5T8I3 360 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEL1L3Q68CR1 1132 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CES5AQ6NT32 575 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZSR9 355 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTSS1LQ765P7 747 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LURAP1LQ8IV03 231 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC185Q8N715 623 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM170AQ8WVE7 144 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C18orf8Q96DM3 657 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIPOR3Q96MK2 946 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPHOSPH8Q99549 860 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOSTQ9BQB4 213 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A18Q9H1K4 315 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAD21L1Q9H4I0 556 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACSL5Q9ULC5 683 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNJ14Q9UNX9 436 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 A3GALT2U3KPV4 340 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATRXP46100 2492 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEB17A8MXT2 336 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPM2AB3EWF7 344 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLRF2D3W0D1 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP5K1BO14986 540 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNHIT1O43257 154 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCK2O43639 380 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLK8O60259 260 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HBP1O60381 514 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXH1O75593 365 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL18O95568 372 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EML2O95834 649 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR3C1P04150 777 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G4BP0C869 781 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM106CPP0CH98 169 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 G6PDP11413 515 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGMTP16455 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD58P19256 250 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSH3P20585 1137 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDIT3P35638 169 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE1BQ01064 536 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MS4A2Q01362 244 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEDD9Q14511 834 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUNDC3AQ59EK9 446 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL27RAQ6UWB1 636 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASGRP2Q7LDG7 609 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADSSL1Q8N142 457 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEB6Q8N7X4 407 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF611Q8N823 705 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGBL3Q8NEM8 1001 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJC3Q8NFK1 279 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRGPRDQ8TDS7 321 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC38A5Q8WUX1 472 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RSC1A1Q92681 617 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASL10AQ92737 203 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms