RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 OR6B1O95007 311 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 AKT2P31751 481 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NDST2P52849 883 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NETO2Q8NC67 525 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR7D4Q8NG98 312 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ART4Q93070 314 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ITGA1P56199 1179 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DAOAP59103 153 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TAC4Q86UU9 113 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FPGTO14772 594 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 COL6A1P12109 1028 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PTSQ03393 145 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CLDN4O14493 209 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PCCBP05166 539 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ENPEPQ07075 957 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SMYD1Q8NB12 490 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC9A7Q96T83 725 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 BTRCQ9Y297 605 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC31A1O15431 190 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CLPTM1O96005 669 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ITPKBP27987 946 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GPD2P43304 727 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SEC13P55735 322 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CDC42P60953 191 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RORBQ92753 470 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CENPXA8MT69 81 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RFXANKO14593 260 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NRP1O14786 923 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 INSIG1O15503 277 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MFSD11O43934 449 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TSPAN19P0C672 248 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TPSB2P20231 275 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TPSAB1Q15661 275 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KRT77Q7Z794 578 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SHDQ96IW2 340 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 COPG2Q9UBF2 871 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 BIRC5O15392 142 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LRCH4O75427 683 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CMPK1P30085 196 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C11orf88Q6PI97 169 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C19orf60Q96EN9 201 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SGK2Q9HBY8 427 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM24O15164 1050 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TSPAN8P19075 237 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GBE1Q04446 702 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZBTB2Q8N680 514 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ITCHQ96J02 903 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MATN3O15232 486 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SYN1P17600 705 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IL10RBQ08334 325 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PDGFRLQ15198 375 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 WNT7AO00755 349 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms