RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RTTNQ86VV8 2226 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y8X5 98 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 AQP9O43315 295 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB14O43829 449 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SH3BGRLO75368 114 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KRT14P02533 472 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VAV1P15498 845 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 BCKDHBP21953 392 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 NUDT1P36639 197 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF77Q15935 545 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC38Q502W7 563 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PPM1NQ8N819 430 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 BIRC7Q96CA5 298 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NXPE2Q96DL1 559 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR2M4Q96R27 311 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RARRES3Q9UL19 164 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 CENPFP49454 3210 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PRRT4C9JH25 899 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GRID2O43424 1007 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HRO43593 1189 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CACNG3O60359 315 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MPOP05164 745 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ADRB3P13945 408 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DPA1P20036 260 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TGM2P21980 687 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MMP8P22894 467 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MYRFLQ96LU7 910 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NDC1Q9BTX1 674 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM245Q9H330 911 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CASS4Q9NQ75 786 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WWOXQ9NZC7 414 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 LATO43561 262 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF15O95150 251 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ALPPP05187 535 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IVLP07476 585 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ITGA3P26006 1051 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KRT20P35900 424 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP25P42331 645 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IL10RBQ08334 325 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ACAP1Q15027 740 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.44□□□□□ -1.7
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