RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ARMCX1Q9P291 453 aa17.87■□□□□ 0.45
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ACTB-201ENST00000331789 KRT16P08779 473 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CD1DP15813 335 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 HNF1BP35680 557 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A3P40879 764 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R42Q7RTR8 314 aa17.84■□□□□ 0.45
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