RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJA2O60884 412 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NME5P56597 212 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NKX3-2P78367 333 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IL10RBQ08334 325 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IL23RQ5VWK5 629 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FATE1Q969F0 183 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF711Q9Y462 761 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 DRGXA6NNA5 263 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 H3BMM5 538 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 E2F6O75461 281 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GLP2RO95838 553 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CD1DP15813 335 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GATMP50440 423 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SH3BP2P78314 561 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SQLEQ14534 574 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OR4D1Q15615 310 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAR2Q96K12 515 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 BTBD9Q96Q07 612 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 UBXN8O00124 270 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM38O00635 465 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 EOMESO95936 686 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PBX3P40426 434 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FOXA1P55317 472 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LIN52Q52LA3 116 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GIPC2Q8TF65 315 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IL37Q9NZH6 218 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 VNN2O95498 520 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CRTAMO95727 393 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SLC10A3P09131 477 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FDXRP22570 491 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PMLP29590 882 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CHN2P52757 468 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GRM2Q14416 872 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF235Q14590 738 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0J9YVX5 310 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 C9JVG2 144 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ASLP04424 464 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 STX5Q13190 355 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PFKFB4Q16877 469 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT7Q86SF2 657 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OR7D4Q8NG98 312 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 L3HYPDHQ96EM0 354 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MPP4Q96JB8 637 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 EXOC2Q96KP1 924 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 KCNA7Q96RP8 456 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GTL3 188 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM92AA1XBS5 289 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF11O60813 436 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PGM3O95394 542 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV3-27P01718 113 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 HERVK_113P63132 956 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CDKL1Q00532 357 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PARP15Q460N3 678 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.34■□□□□ 0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms