RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RIN3Q8TB24 985 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ISL2Q96A47 359 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TBATAQ96M53 351 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF12Q99081 682 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR22Q99680 433 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PITPNM3Q9BZ71 974 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PKP3Q9Y446 797 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD3Q9Y597 815 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL5AQ9Y689 179 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HEPACAM2A8MVW5 462 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 BIRC5O15392 142 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FZD6O60353 706 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HAUS5O94927 633 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP17A1P05093 508 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 C2P06681 752 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PIRTP0C851 137 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 COL6A2P12110 1019 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 STMN1P16949 149 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMA3P25788 255 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC1A2P43004 574 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB4P48594 390 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ST8SIA6P61647 398 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HYAL1Q12794 435 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC153Q494R4 210 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FUT11Q495W5 492 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG16L1Q676U5 607 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MICALCLQ6ZW33 695 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ADIPOR2Q86V24 386 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND6AQ8IWF6 608 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 YAF2Q8IY57 180 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC63Q8NA47 563 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC3BQ96PB8 259 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC1Q99614 292 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 APOL5Q9BWW9 433 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX15Q9NRS6 342 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DEC1Q9P2X7 70 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PHTF1Q9UMS5 762 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVW-1Q9UQF0 538 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT9Q9Y305 439 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1671Q9BY89 1806 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LPK6 155 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR91A4D1P6 747 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ERICH4A6NGS2 130 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 BNIP3LO60238 219 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DLDP09622 509 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TAC1P20366 129 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 OGNP20774 298 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SAT1P21673 171 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DRD4P21917 467 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRB3P28472 473 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXN2P32314 431 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGCLP35914 325 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ETV4P43268 484 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA12P43365 314 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSDP51689 593 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCN5P51795 746 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS15P98073 1019 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms