RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNDC16Q9P2K2 825 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6L10A6NI86 522 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM23A6NLE4 172 aa27.4■■□□□ 1.98
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FETUBQ9UGM5 382 aa27.39■■□□□ 1.98
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GOT2P00505 430 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARNTP27540 789 aa27.38■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14C36Q8NHC7 312 aa27.37■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB9Q96C00 473 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 IER2Q9BTL4 223 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51F1A6NGY5 319 aa27.36■■□□□ 1.97
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