RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 AP2M1Q96CW1 435 aa25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SPASTQ9UBP0 616 aa25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TRIM38O00635 465 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SIGLEC6O43699 453 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 NDST3O95803 873 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PIRTP0C851 137 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 KELP23276 732 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TRIM23P36406 574 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 BLKP51451 505 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 WNT3AP56704 352 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ALG11Q2TAA5 492 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 OR4C6Q8NH72 309 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ABCG8Q9H221 673 aa25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SCAMP1O15126 338 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 RASGRP1O95267 797 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TRIM16O95361 564 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SLC4A1P02730 911 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 GPR1P46091 355 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 HK3P52790 923 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 C1orf61Q13536 156 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 HEATR4Q86WZ0 1026 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 IPMKQ8NFU5 416 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TRIM58Q8NG06 486 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 LGR4Q9BXB1 951 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 GBA3Q9H227 469 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 NLGN3Q9NZ94 848 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 PKD2L2Q9NZM6 624 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SPTBN2O15020 2390 aa25.09■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TMEM202A6NGA9 273 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 CTSEP14091 401 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 DPTQ07507 201 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 DNAJC3Q13217 504 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 MPP3Q13368 585 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TCEA2Q15560 299 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 KDELC1Q6UW63 502 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 NRSN1Q8IZ57 195 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SCAMP4Q969E2 229 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 LRRC61Q9BV99 259 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa25.08■■□□□ 1.61
PDF-201ENST00000288022 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 TNFP01375 233 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 DAB2P98082 770 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 CDKN3Q16667 212 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 DEFB133Q30KQ1 61 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 CCDC110Q8TBZ0 833 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 PDXPQ96GD0 296 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 DUSP23Q9BVJ7 150 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 TEX101Q9BY14 249 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 ZNF711Q9Y462 761 aa25.07■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 GCATO75600 419 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 ANXA9O76027 345 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 GIMD1P0DJR0 217 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 CKMT2P17540 419 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 SPINK2P20155 84 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 SPINT3P49223 89 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 GEMP55040 296 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 CDK3Q00526 305 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 PRPSAP1Q14558 356 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 OR1E3Q8WZA6 343 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.06■■□□□ 1.6
PDF-201ENST00000288022 TBATAQ96M53 351 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms