RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CDH9Q9ULB4 789 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 H3BMQ9 156 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CCL22O00626 93 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ARPC2O15144 300 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CDK14O94921 469 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC5A3P53794 718 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 EXT2Q93063 718 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 HDAC10Q969S8 669 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MYLPFQ96A32 169 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 LRRC58Q96CX6 371 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 COG8Q96MW5 612 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 DOK1Q99704 481 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.92□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 EI24O14681 340 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 IRAK2O43187 625 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 S1PR4O95977 384 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 FGF4P08620 206 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GFAPP14136 432 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 DCKP27707 260 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CLCNKBP51801 687 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 RAB39AQ14964 217 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GALNT7Q86SF2 657 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TRPV3Q8NET8 790 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GIPC1O14908 333 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CLOCKO15516 846 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TREHO43280 583 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 F2P00734 622 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MYL3P08590 195 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC26A3P40879 764 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ARSDP51689 593 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 APLP1P51693 650 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GPR107Q5VW38 600 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 AFMIDQ63HM1 303 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 KCNA7Q96RP8 456 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CD320Q9NPF0 282 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MPP6Q9NZW5 540 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 HTTP42858 3142 aa14.91□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 OR51F1A6NGY5 319 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 AZIN1O14977 448 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MATN4O95460 622 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 C7P10643 843 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CD1DP15813 335 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 BDNFP23560 247 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 HMOX2P30519 316 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ADAM17P78536 824 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GEN1Q17RS7 908 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 KANK2Q63ZY3 851 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GID8Q9NWU2 228 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PPW3 197 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC7A4O43246 635 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 PEX11BO96011 259 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 GPIP06744 558 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CAPGP40121 348 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 MAXP61244 160 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 IHHQ14623 411 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CYP51A1Q16850 503 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 DDIASQ8IXT1 998 aa14.9□□□□□ -0.02
SYP-201ENST00000263233 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms