RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.88□□□□□ -0.03
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GATC-201ENST00000229384 JCHAINP01591 159 aa14.84□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 IVLP07476 585 aa14.84□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 ZNF30P17039 623 aa14.84□□□□□ -0.03
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GATC-201ENST00000229384 CCKBRP32239 447 aa14.84□□□□□ -0.03
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