RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 NEMP1O14524 444 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 ELFN1P0C7U0 828 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 ACADMP11310 421 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 SUOXP51687 545 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 STC1P52823 247 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 LIPIQ6XZB0 460 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 CYTH2Q99418 400 aa22.97■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 FAM159BA6NKW6 160 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 BPIP17213 487 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 PSMA3P25788 255 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 LIG3P49916 1009 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 ZBTB16Q05516 673 aa22.96■■□□□ 1.27
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USF2-201ENST00000222305 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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USF2-201ENST00000222305 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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USF2-201ENST00000222305 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 PGBD3Q8N328 593 aa22.96■■□□□ 1.27
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USF2-201ENST00000222305 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 SCML1Q9UN30 329 aa22.96■■□□□ 1.27
USF2-201ENST00000222305 SMIM23A6NLE4 172 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 HADHAP40939 763 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ZNF844Q08AG5 666 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ALS2CLQ60I27 953 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CYS1Q717R9 158 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM124AQ86V42 546 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PPM1NQ8N819 430 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CD84Q9UIB8 345 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.95■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SLC7A4O43246 635 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 UGT1A9O60656 530 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MC4RP32245 332 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SLCO1A2P46721 670 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MTAPQ13126 283 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PEX6Q13608 980 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 GPR26Q8NDV2 337 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.94■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.94■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 H0Y858 1186 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 PRSS56P0CW18 603 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 GCAP28676 217 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 SPINT3P49223 89 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 RUFY1Q96T51 708 aa22.93■■□□□ 1.26
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USF2-201ENST00000222305 AP1G1O43747 822 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 C6P13671 934 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SPAM1P38567 509 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TPMTP51580 245 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ADPRHP54922 357 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 XIAPP98170 497 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 NEPROQ6NW34 567 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.93■■□□□ 1.26
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