RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	MATN3	O15232	486 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	CNTN5	O94779	1100 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	CPOX	P36551	454 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	CDK18	Q07002	472 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A087WXM4	84 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	ENPP3	O14638	875 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	DCLK1	O15075	740 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	HS6ST1	O60243	411 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX19	Q92543	992 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	TCF12	Q99081	682 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR21	Q99679	349 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0U1RQS6	177 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP6C	O00743	305 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	RHOC	P08134	193 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	AKT1	P31749	480 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF10	Q12962	218 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-223	ENST00000639525		M0R3G1	203 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNA5	P22460	613 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNC	P24863	283 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJB2	P25686	324 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	IL5RA	Q01344	420 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ITFG1	Q8TB96	612 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525		F8W810	466 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC22B	O75396	215 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CNMD	O75829	334 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GSN	P06396	782 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SDHD	O14521	159 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	EI24	O14681	340 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	GRID2	O43424	1007 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	LRAT	O95237	230 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	ACVRL1	P37023	503 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DIO3	P55073	304 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DAB2	P98082	770 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP4	Q13115	394 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-223	ENST00000639525	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.76	□□□□□ -0.53

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