RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637532.1

ARID1B-225, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-225	ENST00000637532	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532		Q6ZVL8	140 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SNX19	Q92543	992 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SNF8	Q96H20	258 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532		A0A1W2PPC4	97 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MEI4	A8MW99	385 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PSMD11	O00231	422 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RAD51B	O15315	384 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	GM2A	P17900	193 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ITPKA	P23677	461 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HMGCL	P35914	325 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	NUDT1	P36639	197 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ETV3	P41162	512 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SPINT3	P49223	89 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ITGA8	P53708	1063 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	STAT4	Q14765	748 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	POU6F1	Q14863	301 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SERAC1	Q96JX3	654 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	WHRN	Q9P202	907 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SMAP	O00193	183 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	TP73	O15350	636 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LDB2	O43679	373 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	TMEM63A	O94886	807 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CRTAM	O95727	393 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SLC4A1	P02730	911 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	C1S	P09871	688 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MLN	P12872	115 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ADRA1D	P25100	572 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MGAT1	P26572	445 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MTM1	Q13496	603 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	LRRC14	Q15048	493 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	AGER	Q15109	404 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	PIGK	Q92643	395 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ARID1B-225	ENST00000637532	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.35	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms