RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 ISL2Q96A47 359 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 HMCESQ96FZ2 354 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 PHF12Q96QT6 1004 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 CCT7Q99832 543 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 RNF38Q9H0F5 515 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 GKN1Q9NS71 199 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 C2orf78A6NCI8 922 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 DRGXA6NNA5 263 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 ACOT8O14734 319 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 LINC00271P0C7V0 271 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 ME2P23368 584 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 PPM1AP35813 382 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 FIBCD1Q8N539 461 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 IL12RB2Q99665 862 aa18.47■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 LILRB3O75022 631 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TACR2P21452 398 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 GMPRP36959 345 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 NDST2P52849 883 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 PKNOX1P55347 436 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 VEPH1Q14D04 833 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF597Q96LX8 424 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.46■□□□□ 0.55
AP000997.3-201ENST00000623333 C7orf72A4D263 438 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 G3V2L1 256 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 J3KR12 359 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CSPG5O95196 566 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 H6PDO95479 791 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC6A4P31645 630 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 DPP6P42658 865 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 HERC3Q15034 1050 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 DENND1CQ8IV53 801 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 LGI2Q8N0V4 545 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 SMYD1Q8NB12 490 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 RCN3Q96D15 328 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 PLGRKTQ9HBL7 147 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.46■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM221A6NGB7 291 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 MATN2O00339 956 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 PGAM1P18669 254 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 EPHA3P29320 983 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CD97P48960 835 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CBX3Q13185 183 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 PRPSAP1Q14558 356 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CES3Q6UWW8 571 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 LPCAT2Q7L5N7 544 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CARM1Q86X55 608 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TNS4Q8IZW8 715 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 SNX15Q9NRS6 342 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 FNIP2Q9P278 1114 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 ACSL4O60488 711 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 KLKB1P03952 638 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 HLA-DQB2P05538 268 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 OR1E1P30953 314 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 GP5P40197 560 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TUBA4AP68366 448 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 FPGSQ05932 587 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CYTH1Q15438 398 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 STON2Q8WXE9 905 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 ZBP1Q9H171 429 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR41Q9HAD4 459 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 GLOD4Q9HC38 313 aa18.44■□□□□ 0.54
AP000997.3-201ENST00000623333 CASS4Q9NQ75 786 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms