RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ASF1AQ9Y294 204 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGES3LE9PB15 166 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 BMP10O95393 424 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ADH1CP00326 375 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CXCR2P25025 360 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKAG1P54619 331 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BN98 237 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CTSEP14091 401 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPKAPK2P49137 400 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DLG2Q15700 870 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR21Q99679 349 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MYOCQ99972 504 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CPQQ9Y646 472 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 IRAK2O43187 625 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NDST2P52849 883 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC142Q17RM4 750 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 IRGCQ6NXR0 463 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DEC1Q9P2X7 70 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR180Q86V85 440 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TLE6Q9H808 572 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC28A1O00337 649 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PLIN3O60664 434 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCY1B2O75343 617 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 IDO1P14902 403 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PROX1Q92786 737 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 AZIN2Q96A70 460 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 B3GALT6Q96L58 329 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NDEL1Q9GZM8 345 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 REEP1Q9H902 201 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 GRB14Q14449 540 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NEDD8Q15843 81 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 C7orf26Q96N11 449 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGVQ9NUD9 493 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF9O43307 516 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TBX18O95935 607 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 F2P00734 622 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT20P35900 424 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 BCO2Q9BYV7 579 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINI2O75830 405 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 FGBP02675 491 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC7A2P52569 658 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KLF10Q13118 480 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CD101Q93033 1021 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NMUR1Q9HB89 426 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PSME2Q9UL46 239 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0U1RQF3 1178 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM20BO75063 409 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NCF4Q15080 339 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK20Q8IZL9 346 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NTAN1Q96AB6 310 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 APOL4Q9BPW4 351 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 RHBGQ9H310 441 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTN3Q9P232 1028 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 IL10RBQ08334 325 aa20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms