RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 TTLL8A6PVC2 850 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP69A5D8W1 941 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 PELI3Q8N2H9 469 aa21.76■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL3Q9UH77 587 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.75■■□□□ 1.07
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